軸流泵的運行包括充水、啟動、運行和停止，軸流泵與離心泵相比較，兩者在結構上有不同之處，軸流泵有其特殊的地方。中、小型軸流泵特別是臥式軸流泵或小型立式軸流泵，大多是安裝在高于水面的位置，所以，它在啟動前，泵殼和吸入喇叭口必須先充滿水。同樣，在有空氣存在的情況下，泵內和吸入管就無法形成真空。這種情況下，一般都另設一臺到幾臺電動真空泵，利用它們將泵殼和吸入喇叭口內的空氣抽出，形成真空，進而達到充水的目的。